1、动物组织样本
① 5min内取样，组织块不超过1cm片状，用PBS轻轻漂洗将样本表面的血污，毛发等去掉；
② 取材时一定注意避免镊子挤压等机械损伤，刀片要锋利避免挫伤组织。注意保护扫描面；
③组织取下后立即投入电镜固定液，4℃保存运输，在保存和运输过程中固定液切勿冷冻结冰。
2、细胞样本
贴壁细胞：细胞必须贴壁于盖玻片上制成爬片（24孔板内），弃培养基，用PBS轻轻漂洗后，弃PBS，立即加入电镜固定液，4℃保存运输；
3、细菌样本
固体培养基的细菌：细菌必须贴壁于盖玻片上制成爬片（24孔板），用盖玻片轻轻覆盖在菌落上，在培养箱培养一晚上，第二天轻轻揭下来，放入固定液中。
悬浮细菌孢子等：离心收集细菌，弃培养基后用PBS轻轻漂洗后，弃PBS加电镜固定液，吹散悬浮于固定液内。
4、其他如粉末状材料
直接准备干燥的粉剂，带有磁性的金属材料不能做扫描电镜。